نفت شركة العاصمة الإدارية الجديدة، تخصيص الحكومة 35 مليار جنيه من ​الموازنة العامة​ تكلفة إنشاء الحي الحكومي بمشروع العاصمة الإدارية الجديدة، ما يكبد الخزانة العامة أعباءً إضافية.

وأشارت الشركة، الى أن ميزانية العاصمة الإدارية الجديدة مستقلة ومنفصلة تماماً عن الموازنة العامة للدولة، وتعتمد على ​إيرادات​ الشركة من حصيلة بيع الأراضي بالمشروع للمستثمرين ومن ثم توجيه إنفاقها في تمويل عمليات الإنشاء وسداد مستحقات ​المقاولين​ والعمال بها،.